中心按照《江苏省工程技术研究中心管理办法》的要求，组建了管理委员会和技术委员会。中心实行管委会领导下的中心主任负责制，独立运行。下设一室四部一基地，即综合办公室、技术研发部、人才培训部、实验测试部、项目开发部以及与院校共同建立的产学研一体化实验基地。